三种合作办学模式因投资举办主体的不同而在学校的经营管理等方面呈现出不同的特点。以企业投资办学为主体的学校，在学校董事会人员构成中，企业代表和承办方学校各占近一半比例，但是企业作为学校举办方对学校的运营、人事和管理等拥有更大的控制权。这种办学模式的优点在于企业承担了学校投资和办学经费，积极调动了企业的办学积极性，其不足在于企业办学主导可能对学校专业办学形成不正当干预。以地方政府为投资主体的合作校，地方政府机构人员在理事会中占据较大比例，拥有较多决策控制权，或者通过向合作校派驻执行校长担任学校法人的形式，对学校的发展和运营具有较大影响力。其优点在于保障学校经费和人事编制的稳定性，不足在于难以克服地方政府管理存在的体制机制障碍。北京八中固安分校和景山学校曹妃甸分校基本属于上述办学模式。北师石附的办学模式较为独特，该校虽然是地方政府投资举办，但地方政府并没有给学校派驻执行校长担任法人，而是由承办方北师大教育集团直接派驻的校长担任学校法人。学校理事会构成中，地方政府和承办学校几乎各占一半比例，承办校对学校的运营和管理具有重要影响力，也给承办校的自主性发挥留出了较大的空间，是办学权较为分散的一种合作办学形式，能够保障各合作主体积极性的发挥。当然，这种办学模式也面临着地方政府管理存在的体制机制障碍。因此，合作办学模式顺利运营很大程度上取决于地方政府的态度和是否能够为办学解决相关的经费和人事编制等。在组织结构上，合作校普遍采取扁平化管理。例如，北师石附将年级组实体部门化，全校形成1～3学段、4～6学段和7～9学段三大学部。赋予学部自治权，在遵守学校章程和规划的前提下，学部可以自主进行内部事务管理。课程教学部、学生服务中心、人力资源部和后勤保障部等则形成直属服务部门，主要起督导评估和服务职能，弱化其直接管理职能。同时，对于创新性工作，学校还实行项目制管理，即召集各部门人员形成团队进行集体攻关。这种扁平化和项目制管理有利于减少管理层级，打破部门分割，推动学校创新。

1.师资配置和培养机制

合作校的师资主要由两部分构成，一部分是北京承办方学校派驻的骨干教师，他们通常担任学校的年级组长和教研组长，帮助合作校制订教学计划和课程方案等，另外一部分是由地方教育主管部门聘任的师资。合作校通常会借鉴承办学校在师资聘任、管理和培养等方面的经验和做法。在师资的聘任方面，合作校一般会依托北京承办方学校招聘和培训新教师。在师资培养上，合作校一方面可以利用派驻干部教师的听评课、备课指导、班主任培养等加强本地师资队伍建设，另一方面可以共享北京承办学校提供的各类师资培训服务。以北师石附为例，按照协议，北师石附的师资统一由北师大教育集团招聘，这样可以充分利用北师大品牌和标准面向全国选拔高素质的教师。同时，学校可以免费享受北师大教育集团提供的集团培训、学校需求性培训等师资培训服务。集团培训是教育集团为附属学校校长或副校长、学校干部、班主任、骨干教师、新教师等举行的各种分类培训，采取统一定点形式，每个附属学校每年必须达到一定量。学校需求性培训是大学教育集团针对附属学校的需求安排的培训类型，采取专家到校形式。根据调查，学校需求性培训占据主导地位，这样有利于增强大学资源导入附属学校的针对性和有效性。